Uzun bir bakaya ve askeri mahkeme süreci sonucunda 1999 yılı Mayıs ayında askerlik görevimi yerine getirmek için Samsundaki eğitim birliğine teslim oldum. 45 günlük eğitim sonrasında kura ile Tunceli 4 üncü Komando Tugayı 2 nci Komando Taburuna Tabip Asteğmen olarak atandım. 14 ay süren, içlerinde Ali boğazı, Kutu dere, Bali deresinin de yer aldığı, Tunceli’nin yanı sıra, Elazığ, Bingöl ve Diyarbakır’ı da içeren dördü uçarbirlik kırktan fazla operasyonda görev alarak, 2000 yılı Eylül ayında Tabip Teğmen rütbesiyle terhis oldum. Görev sürem boyunca, operasyonların yanı sıra, sigaranın zararları, ağız diş sağlığı, kuduzla mücadele, doğum kontrolu ve aile planlaması gibi konularda birlik askerlerine eğitim verdim. Yeni konuşlanan bir birlik olması nedeniyle yaşanan hijyen sorunlarının kaynağının tespiti için uyarılarda bulundum. Bu çalışmalar çerçevesinde Tugay komutanı tarafından 7 Mart 2000 de bir takdirname verildi.